Genetyczny czynnik ryzyka dla okresowych ruchów kończyn w czasie snu czesc 4

Na podstawie metody kontroli genomowej36 i procedury symulacji wykorzystującej znaną genealogię, którą wcześniej stosowaliśmy (patrz Dodatek dodatkowy), współczynnik korekty wynosił 1,117 dla osób z Islandii i 1,216 dla osób w Stanach Zjednoczonych. Wykorzystaliśmy model Mantela-Haenszela37, aby połączyć wyniki z próbek islandzkich i amerykańskich. Wyniki
Markery genomowe
Ryc. 1. Ryc. 1. Nierównowaga sprzężenia w locus BTBD9. Markery znaczące dla genomu, rs3923809 i rs6923737, są umiejscowione w nakładających się na siebie blokach rozdzielających, blokujących części DNA domeny BTB (POZ) 9 (BTBD9), glioksalazy I (GLO1) oraz markery w regionie promotora dyneinowy, aksonalny, ciężki polipeptyd 8 (DNAH8). Blok znajduje się w sąsiedztwie genu 27 eksponowanego w jądrach (TEX27). Dane pochodzą z międzynarodowego projektu HapMap o pojedynczym nukleotydowym polimorfizmie (SNP) (wydanie 19) próbek z Centre d Etude du Polymorphisme Humain z Utah.
Tabela 1. Tabela 1. Związek pomiędzy allelem A SNP rs3923809 i RLS z periodycznymi ruchami nóg w śnie u osób z Islandii i Stanów Zjednoczonych. Aby zminimalizować heterogeniczność fenotypową, skoncentrowaliśmy naszą początkową analizę asocjacji genomu na 306 osobach z RLS, którzy również mieli okresowe ruchy kończyn w czasie snu. Dwa markery, rs3923809 i rs6923737, w intronie genu 9 (BTBD9) zawierającego domenę BTB (POZ) na chromosomie 6p21.2 (Figura 1) wykazały asocjacje z całym genomem, które były znaczące (dla rs3923809: iloraz szans, 1,8; P = 2 × 10-9; dla rs6923737: iloraz szans, 1,7; P = × 10-7) (Tabela oraz Rys. i Tabela 2 Dodatku dodatkowego). Po skorygowaniu dla rs3923809, związek z rs6923737 był już nieistotny (P = 0,16), podczas gdy związek z rs3923809 pozostawał istotny po skorygowaniu dla rs6923737 (P = 0,001). Żaden z pozostałych 70 SNP w regionie o wielkości około 600 kb wokół rs3923809 nie był istotny po korekcie dla rs3923809 i wielokrotnym testowaniu. Powiązanie z rs3923809 pozostało znaczące po dostosowaniu dla każdego z SNP indywidualnie (Tabela 2 Dodatku Aneks).
Aby potwierdzić te wyniki, przeanalizowaliśmy drugą islandzką próbkę 123 pacjentów z RLS i okresowymi ruchami kończyn we śnie oraz 1233 kontroli. Wyniki z drugą próbą znacząco powtórzyły oryginalne wyniki dla rs3923809 (iloraz szans, 1,8; P = 4 × 10-4) (tabela i tabela 2 dodatku uzupełniającego). Rozszerzenie wysiłku replikacji na trzecią próbę 188 osób z RLS i okresowymi ruchami kończyn podczas snu i 662 kontrole ze Stanów Zjednoczonych dodatkowo potwierdziły początkowy wynik dla rs3923809 (iloraz szans, 1,5; P = 0,004) (Tabela 1). Po połączeniu wszystkich trzech próbek związek pomiędzy allem A rs3923809 i RLS oraz okresowymi ruchami kończyn we śnie był bardzo znaczący (iloraz szans, 1,7; P = 3 × 10-14). Nie stwierdzono istotnego odchylenia od modelu multiplikatywnego, który zakładał, że stosunek ryzyka dla nosicieli homozygotycznych (AA) do nosicieli heterozygotycznych (AG) był taki sam jak stosunek ryzyka dla nosicieli heterozygotycznych do nosicieli homozygotycznych (GG) zarówno w języku islandzkim podmioty i USA
[hasła pokrewne: cogito siemianowice, szew kapciuchowy, salonik wróżb ]